运动肾疼可能是肾结石、肾下垂、肾囊肿、肾盂肾炎、腰肌劳损、其他等原因引起，可在医生的指导下，通过药物治疗和手术治疗等方式进行改善。
1、肾结石：是指沉积在肾脏部位的结石，如果在运动时肾脏部位的结石移动幅度比较大，容易对肾脏黏膜造成摩擦，刺激到肾脏神经，可使患者出现运动肾疼的症状。如果肾结石较小，可在医生的指导下多喝水，还可使用排石颗粒，帮助结石排出，如果肾结石较大，还可行体外冲击波碎石术、经皮肾镜碎石术等手术。
2、肾下垂：是指肾脏随呼吸活动所移动的位置超出正常范围，运动时腹压降低，从而引起肾下垂，导致患者出现运动肾疼的症状。通常可在医生的指导下使用补中益气丸、六味地黄丸等药物，以进行治疗。
3、肾囊肿：是指发生在肾脏部位的囊肿，患者通常会出现患侧腹痛或胃部胀痛的症状。在运动时因为身体晃动幅度较大或引发囊肿破裂，就会引起运动肾疼的症状，患者可在医生的指导下行囊肿穿刺术等手术治疗。
4、肾盂肾炎：通常是因为细菌感染引起，因为炎症对肾脏的刺激，从而容易引起腰部酸痛的症状，在运动后使症状加重，可表现为运动肾疼。患者可在医生的指导下使用盐酸环丙沙星片、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物进行治疗。
5、腰肌劳损：通常是因为过度负重、腰部活动的姿势不良等原因引起，腰部肌肉、筋膜以及韧带可发生损伤，从而引起腰部慢性无菌性炎症。在运动时如果对腰部损伤的肌肉、筋膜以及韧带发生牵拉，就容易引起腰疼的症状，使患者出现运动肾疼的感觉。通常可在医生的指导下使用布洛芬缓释片、塞来昔布胶囊等药物进行治疗。
6、其他原因：例如马蹄肾、输尿管结石、肾盂输尿管连接部狭窄、腰椎骨质增生、胃炎、感染等因素，也可能是由于剧烈运动后交感神经兴奋，导致腰部肌肉痉挛、疼痛引起。通常需要根据不同原因治疗，例如输尿管结石可以进行手术治疗。
如果患者的症状一直得不到缓解，应及时去正规医院肾脏内科进行检查，例如叩诊、泌尿系统彩超等检查，明确病因，积极配合医生进行治疗。